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实验室洁净系统中的洁净室对门窗的密闭性有要求，保证使用的同时，不会对室内的洁净度有影响。

生物安全实验室是以洁净实验室为主，常见的是分子生物学实验室和微生物实验室。此类实验室主要注意的是实验对像是否具有危害性，并正确界定实验室的安全级别，确保系统的独立性，防止彼此间的交叉污染；根据生物安全实验室的安全水平定位洁净室级别（包括：基础实验室--一级生物安全水平[BSL-1，又称P1实验室，P意思是“物理防护”，英文全称“physical protection”]；基础实验室--二级生物安全水平[BSL-2，又称P2实验室]；防护实验室--三级生物安全水平[BSL-3，又称P3实验室]；防护实验室-- 四级生物安全研究水平[BSL-4，又称P4实验室，是防护水平的实验室]），制定现代化的生物安全实验室设计方案：
一、工艺布置设计的参照
1、制定实验楼每个部门、每个实验室的面积和功能要求。
2、制定生物实验室每间房的建筑、装修内容，门窗要求，环境控制。
3、电力(照明、通讯及网络等)、气体管道、给排水、空调、集中控制、施工工艺、检测、培训、消防控制等设计的要求。
4、制定每间生物安全实验室所需固定实验设备清单。
二、参照国际生物安全实验室标准项目工艺的要求，制定生物实验室固定设备规划、平面布置图、生物安全实验室详细放大结构平面图、细节部立面图和剖面图；备份生物实验室固定设备厂商资料及工程设计数据总明细。
三、建筑布局和装修方案是洁净实验室安全运行的基础。因微生物的病菌危险性，必须防止危险微生物往外界泄漏，扩散，污染。全面的隔断危险性微生物与外部的接触途径，也避免受外界的污染，影响试验效果的准确性，采取合理布局和装修方案是必须的。首先照按实验室布局要求合理划分成清洁区、半污染区、污染区，人与物分别设置**通道，必要的缓冲间，采用一次和二次隔离措施，有效避免交叉污染。采用质量可靠材料，合理施工措施，**洁净实验室生物安全实验室始终处在相对密封的要求，防止微生物的外逸，易于清理消毒。
洁净室的平面布局可以参照几种方式：
1、内廊式：洁净室设在外围，而走廊设在内部，这种走廊的洁净度级别一般都较高，甚至和洁净室同级。
2、外廊环绕式：外廊可以有窗和无窗，兼作参观和放置一些设备用，有的在外廊内设值班采暖。外窗必须是双层密封窗。
3、两端式：洁净区设在一边，另一边设准洁净和辅助用房。
4、核心式：为了节约用地、缩短管线，可以洁净区为核心，上下左右被各种辅助用房和隐蔽管道的空间包围起来，这种方式避开室外气候对洁净区的影响，减少了冷热能耗，利于节能。

实验室洁净系统的平面和空间设计，将洁净实验区和人员净化、设备材料净化和其他辅助用房进行分区布置。同时应考虑实验操作、工艺设备安装和维修、气流组织型式、管线布置以及净化空气调节系统等各种技术设施的综合协调效果。